حظي مشرفة ببعض التكريمات الهامة أثناء حياته، ومنها حصوله على تكريم الباشوية من الملك فاروق، وقيل إنه قد رفض هذا التكريم لاعتباره أن أعلى تكريم قد تلقاه هو حصوله على شهادة الدكتوراه. في الوقت الحاليّ، يرتبط اسم علي مصطفى مشرفة بمنحةٍ علمية مرموقة اسمها منحة نيوتن-مشرفة، التي تمثل مشروع تعاون علمي بين مصر وبريطانيا ويتضمن تخصيص مبلغ 50 مليون جنيه إسترليني لدعم الجهود العلمية المشتركة بين البلدين.

للاطلاع على مسيرة حياة العالم المصري علي مصطفى مشرفة، وما حققه من إنجازات علمية، يمكنكم قراءة مقالتنا الكاملة عنه ضمن قسم شخصيات ملهمة على موقعنا من الرابط: